11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2440 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2440  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  253  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00530  hypothetical protein  56 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001948  hypothetical protein  56 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2084  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000115145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3039  hypothetical protein  48.94 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0710  hypothetical protein  47.06 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1821  hypothetical protein  48.89 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0248223  normal  0.847796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1238  hypothetical protein  44.68 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0014098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1669  hypothetical protein  41.86 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2019  hypothetical protein  42.22 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000087016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2024  hypothetical protein  42.22 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>