12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1821 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1821  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0248223  normal  0.847796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2084  hypothetical protein  45.45 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0710  hypothetical protein  47.27 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2024  hypothetical protein  51.02 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2019  hypothetical protein  46 
 
 
57 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000087016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2440  hypothetical protein  48.89 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1669  hypothetical protein  41.82 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0416  hypothetical protein  45.45 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00530  hypothetical protein  40.38 
 
 
199 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3039  hypothetical protein  36.36 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001948  hypothetical protein  41.67 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1238  hypothetical protein  34.55 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0014098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>