13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1469 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1469  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1098    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1510  TPR repeat-containing protein  92.15 
 
 
535 aa  1023    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1449  hypothetical protein  49.72 
 
 
520 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1494  hypothetical protein  49.91 
 
 
520 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1503  hypothetical protein  49.08 
 
 
534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000494578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0225  hypothetical protein  30.8 
 
 
548 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0691  hypothetical protein  29.42 
 
 
572 aa  200  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0679  hypothetical protein  29.8 
 
 
567 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.33124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1521  hypothetical protein  26.87 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1051  hypothetical protein  27.31 
 
 
574 aa  183  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0110  hypothetical protein  28.52 
 
 
483 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1341  hypothetical protein  27.3 
 
 
574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1564  hypothetical protein  27.79 
 
 
573 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>