8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1443 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1443  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  276  8e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.810631  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0916  hypothetical protein  47.67 
 
 
87 aa  77  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1936  paREP8  40.34 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.103141  hitchhiker  0.000000120153 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1335  hypothetical protein  42.27 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.851353  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1496  hypothetical protein  46.91 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1122  paREP8  37.1 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000749738  decreased coverage  0.0000000000491916 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1699  hypothetical protein  25.56 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000729182  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  30.89 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>