12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0713 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0713  MspA family protein  100 
 
 		 266 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4087  hypothetical protein  48.92 
 
 		 343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4117  hypothetical protein  26.37 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5016  hypothetical protein  28.29 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.548773  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2295  hypothetical protein  26.72 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1735  hypothetical protein  27.06 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.997008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5768  hypothetical protein  27.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5017  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.467449  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3857  hypothetical protein  27.46 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3931  hypothetical protein  27.46 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3843  hypothetical protein  26.51 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0256597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4632  MspA family protein  25 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.651534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>