18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1166 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1166  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0643  hypothetical protein  42.67 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0365618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0742  hypothetical protein  51.52 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0161  hypothetical protein  53.57 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0197  hypothetical protein  53.57 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0139  hypothetical protein  44.83 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4816  hypothetical protein  46.3 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1287  hypothetical protein  43.4 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0065  hypothetical protein  43.86 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2481  hypothetical protein  42.31 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0424288  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3095  hypothetical protein  42.31 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0712669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0084  hypothetical protein  38.98 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0177  hypothetical protein  48.98 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2912  hypothetical protein  53.57 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3436  hypothetical protein  53.57 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0187  hypothetical protein  53.57 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2177  hypothetical protein  53.57 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0381  hypothetical protein  53.57 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>