19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1213 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1213  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  149  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1745  hypothetical protein  61.64 
 
 
95 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1610  hypothetical protein  68.35 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00638305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0894  hypothetical protein  48.65 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.141674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0914  hypothetical protein  42.59 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0667  hypothetical protein  48.28 
 
 
84 aa  53.5  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12090  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  34.29 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110798  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0383  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  52  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00717721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  42.86 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2213  membrane bound protein complex subunit mbxD  38.24 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  42.03 
 
 
326 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  45 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0951  hypothetical protein  55.56 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0826725  normal  0.152803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1786  hypothetical protein  47.06 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2582  hypothetical protein  51.35 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  37.1 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  55.32 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  41.18 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0577  hypothetical protein  28.77 
 
 
258 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>