20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0283 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0283  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  134  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000202519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0403  hypothetical protein  73.68 
 
 
64 aa  94  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0374002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0419  hypothetical protein  73.68 
 
 
64 aa  94  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1711  hypothetical protein  71.19 
 
 
64 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0812  hypothetical protein  56.67 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1360  hypothetical protein  57.38 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00229391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0034  hypothetical protein  60 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0884764  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1557  conserved hypothetical cytosolic protein  58.33 
 
 
70 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.151253  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1098  conserved hypothetical cytosolic protein  60.34 
 
 
64 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1756  hypothetical protein  58.93 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03010  hypothetical protein  58.93 
 
 
63 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0417  conserved hypothetical cytosolic protein  52.46 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.938081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2173  hypothetical protein  52.63 
 
 
68 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.49399  normal  0.021975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0760  hypothetical protein  51.85 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0491  hypothetical protein  57.41 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.283795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3308  hypothetical protein  48.33 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.339805 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_456  hypothetical protein  57.41 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.503566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2595  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0515  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2949  hypothetical protein  48.15 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>