20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0515 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0515  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  137  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_456  hypothetical protein  98.48 
 
 
66 aa  136  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.503566  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0491  hypothetical protein  93.94 
 
 
66 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.283795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2595  hypothetical protein  57.14 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03010  hypothetical protein  56.67 
 
 
63 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0417  conserved hypothetical cytosolic protein  59.65 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.938081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3308  hypothetical protein  52.38 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.339805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1711  hypothetical protein  57.63 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0034  hypothetical protein  53.85 
 
 
66 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0884764  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0760  hypothetical protein  51.56 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2173  hypothetical protein  51.72 
 
 
68 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.49399  normal  0.021975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1756  hypothetical protein  49.21 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0419  hypothetical protein  54.39 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0403  hypothetical protein  54.39 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0374002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1098  conserved hypothetical cytosolic protein  43.75 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1360  hypothetical protein  47.37 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0812  hypothetical protein  45 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0283  hypothetical protein  55.56 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000202519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1557  conserved hypothetical cytosolic protein  45.1 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.151253  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2949  hypothetical protein  44.64 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>