27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1253 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1253  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  844    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1254  hypothetical protein  93.38 
 
 
143 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2936  hypothetical protein  45.12 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1255  hypothetical protein  51.27 
 
 
197 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0983588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1252  hypothetical protein  53.01 
 
 
194 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1584  hypothetical protein  38.74 
 
 
351 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1963  hypothetical protein  40.76 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1586  hypothetical protein  43.88 
 
 
218 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1326  hypothetical protein  44.22 
 
 
190 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2933  hypothetical protein  41.67 
 
 
168 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2938  hypothetical protein  47.59 
 
 
143 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1317  hypothetical protein  40.31 
 
 
171 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2937  hypothetical protein  47.37 
 
 
150 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.966639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2939  hypothetical protein  38.06 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  32.87 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2934  hypothetical protein  44.86 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1318  hypothetical protein  47.66 
 
 
118 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1327  hypothetical protein  52.11 
 
 
113 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.361966  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1325  hypothetical protein  50 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1585  hypothetical protein  52.78 
 
 
87 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.338245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1463  hypothetical protein  40.66 
 
 
95 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  38.35 
 
 
137 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1256  hypothetical protein  54.9 
 
 
56 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 
282 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0788  hypothetical protein  32.35 
 
 
373 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1367  hypothetical protein  32.43 
 
 
181 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1370  hypothetical protein  27.13 
 
 
134 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103597  normal  0.856261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>