30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1342 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0166  hypothetical protein  45.7 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  47.33 
 
 
137 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1370  hypothetical protein  41.44 
 
 
134 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103597  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0167  hypothetical protein  50.54 
 
 
99 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1253  hypothetical protein  32.87 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1367  hypothetical protein  32.38 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2936  hypothetical protein  31.6 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1373  hypothetical protein  38.17 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00827993  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0789  hypothetical protein  30.84 
 
 
314 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0788  hypothetical protein  33.91 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2916  hypothetical protein  42.73 
 
 
122 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1252  hypothetical protein  31.93 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1586  hypothetical protein  29.47 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1366  hypothetical protein  38.04 
 
 
104 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0265847  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3082  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000103876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1369  hypothetical protein  41.76 
 
 
102 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0323881  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1372  hypothetical protein  40.28 
 
 
80 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00893716  normal  0.846814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1255  hypothetical protein  30.62 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0983588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1368  hypothetical protein  40.85 
 
 
81 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0277289  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2880  hypothetical protein  41.67 
 
 
103 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0027  hypothetical protein  28.91 
 
 
509 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0790  hypothetical protein  30.16 
 
 
275 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1326  hypothetical protein  30.65 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387491  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1371  hypothetical protein  39.73 
 
 
78 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794296  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1963  hypothetical protein  32.43 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1325  hypothetical protein  35 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0856  hypothetical protein  57.5 
 
 
44 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1317  hypothetical protein  30.53 
 
 
171 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>