15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1217 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1217  putative cyclase II  100 
 
 		 109 aa  226  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3545  Polyketide synthesis cyclase  64.22 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2193  polyketide synthesis cyclase  65.14 
 
 		 109 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0763907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0154  Polyketide synthesis cyclase  48.15 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2389  polyketide synthesis cyclase  50.96 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2855  polyketide synthesis cyclase  46.3 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33670  Polyketide synthesis cyclase  48.62 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4148  hypothetical protein  49.53 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33742  decreased coverage  0.00216926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1090  Polyketide synthesis cyclase  42.86 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3338  Polyketide synthesis cyclase  50 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.554712  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2506  polyketide synthesis cyclase  41.12 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2690  polyketide synthesis cyclase  40.19 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.00127754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2692  polyketide synthesis cyclase  42.06 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2508  polyketide synthesis cyclase  40.37 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0953264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0141  Polyketide synthesis cyclase  38.1 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.443849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>