15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4148 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4148  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33742  decreased coverage  0.00216926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33670  Polyketide synthesis cyclase  62.26 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2389  polyketide synthesis cyclase  57.55 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2855  polyketide synthesis cyclase  51.89 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1090  Polyketide synthesis cyclase  50.48 
 
 		 111 aa  116  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2692  polyketide synthesis cyclase  51.89 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2508  polyketide synthesis cyclase  50 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0953264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2506  polyketide synthesis cyclase  44.86 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2690  polyketide synthesis cyclase  44.86 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.00127754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1217  putative cyclase II  49.53 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0154  Polyketide synthesis cyclase  41.67 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3545  Polyketide synthesis cyclase  44.86 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3338  Polyketide synthesis cyclase  47.57 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.554712  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2193  polyketide synthesis cyclase  41.9 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0763907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0141  Polyketide synthesis cyclase  33.64 
 
 		 272 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.443849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>