12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4779 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4779    100 
 
 
234 bp  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3986    93.1 
 
 
573 bp  317  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2975    83.64 
 
 
716 bp  151  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1150    83.26 
 
 
660 bp  137  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2988    82.81 
 
 
726 bp  129  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0110    81.82 
 
 
661 bp  119  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0280    81.82 
 
 
430 bp  119  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2368    82.24 
 
 
687 bp  115  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2117    81.69 
 
 
437 bp  113  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00222872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3366  hypothetical protein  89.19 
 
 
207 bp  83.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.552771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2025    85 
 
 
456 bp  63.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1511    81.91 
 
 
743 bp  52  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0271821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>