14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3986 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3986    100 
 
 
573 bp  1136    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4779    93.1 
 
 
234 bp  317  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2975    82.96 
 
 
716 bp  125  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1150    82.14 
 
 
660 bp  103  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2988    82.14 
 
 
726 bp  103  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0110    82.01 
 
 
661 bp  97.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0280    82.01 
 
 
430 bp  97.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2368    81.57 
 
 
687 bp  89.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2117    80.47 
 
 
437 bp  77.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00222872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1511    87.34 
 
 
743 bp  69.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0271821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3366  hypothetical protein  86.67 
 
 
207 bp  69.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.552771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0559    90.57 
 
 
368 bp  65.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2576  transposase IS4  96.88 
 
 
1320 bp  56  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2025    87.27 
 
 
456 bp  54  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>