25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3245 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3245    100 
 
 
689 bp  1366    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.02868  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  93.1 
 
 
282 bp  325  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3207    84.4 
 
 
609 bp  105  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4214    90.77 
 
 
537 bp  81.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3603    89.23 
 
 
2855 bp  73.8  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0066  hypothetical protein  85.23 
 
 
210 bp  71.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139123  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5371    91.38 
 
 
1543 bp  67.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.529522 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5381    91.38 
 
 
1608 bp  67.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5415    91.38 
 
 
1608 bp  67.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4584    87.69 
 
 
1296 bp  65.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4492    87.69 
 
 
1052 bp  65.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4180    87.69 
 
 
1668 bp  65.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0085    87.69 
 
 
867 bp  65.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3510    97.22 
 
 
1217 bp  63.9  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3873    94.74 
 
 
1672 bp  60  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2270    86.15 
 
 
1204 bp  58  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342711  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0985    94.59 
 
 
2015 bp  58  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0738083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0851    86.15 
 
 
1674 bp  58  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1013    94.44 
 
 
485 bp  56  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1004    94.44 
 
 
485 bp  56  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.411917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2295    94.29 
 
 
651 bp  54  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2494    94.29 
 
 
663 bp  54  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.907999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3764    94.29 
 
 
678 bp  54  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.375429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3926    94.29 
 
 
633 bp  54  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4216    96.55 
 
 
371 bp  50.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>