18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5381 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5371    99.81 
 
 
1543 bp  3027    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.529522 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5381    100 
 
 
1608 bp  3188    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5415    99.94 
 
 
1608 bp  3180    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0066  hypothetical protein  89.47 
 
 
210 bp  109  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139123  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  87.5 
 
 
282 bp  79.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3207    87.5 
 
 
609 bp  71.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3245    91.38 
 
 
689 bp  67.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.02868  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4214    89.29 
 
 
537 bp  63.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2270    88.68 
 
 
1204 bp  58  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342711  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0784    92.5 
 
 
195 bp  56  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0723059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4492    92.5 
 
 
1052 bp  56  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3603    87.5 
 
 
2855 bp  56  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3873    86.79 
 
 
1672 bp  50.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0085    86.79 
 
 
867 bp  50.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  93.94 
 
 
1104 bp  50.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4584    86.79 
 
 
1296 bp  50.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4845    85.25 
 
 
642 bp  50.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4180    85.71 
 
 
1668 bp  48.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>