34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3073 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3020    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4873    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4858    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4829    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00272298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4553    100 
 
 
1034 bp  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4547    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384821  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3597    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212134  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3591    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3581    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3536    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3186    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.021149  hitchhiker  0.00425796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3076    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3073    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3025    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0055    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2951    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2506    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0983138  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0853    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1025    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1192    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0354803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1203    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22245  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1223    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0184456  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1242    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1387    100 
 
 
587 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1406    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2099    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.115072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2948    100 
 
 
590 bp  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3610  hypothetical protein  100 
 
 
243 bp  482  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.322806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3071  hypothetical protein  100 
 
 
243 bp  482  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2044    89.19 
 
 
1117 bp  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803239  normal  0.125116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4555  hypothetical protein  100 
 
 
750 bp  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0721243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2443  IS4 family transposase  83.59 
 
 
351 bp  212  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354426  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0395    85.11 
 
 
420 bp  75.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0851    87.01 
 
 
444 bp  73.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.735246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>