52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0851 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0851    100 
 
 
444 bp  880    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4553    87.01 
 
 
1034 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4873    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4858    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4829    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00272298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0055    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4547    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384821  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3597    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212134  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3591    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3581    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3536    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3186    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.021149  hitchhiker  0.00425796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3076    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3073    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3025    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3020    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2948    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0853    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1025    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1192    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0354803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1203    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22245  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1223    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0184456  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1242    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1387    87.01 
 
 
587 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1406    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2099    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.115072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2951    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2506    87.01 
 
 
590 bp  73.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0983138  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2044    85.14 
 
 
1117 bp  60  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803239  normal  0.125116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4586    81.15 
 
 
1266 bp  60  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4585    81.15 
 
 
2683 bp  60  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1625    81.15 
 
 
1310 bp  60  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.349042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3452    81.36 
 
 
1253 bp  60  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.83471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5108    81.48 
 
 
1266 bp  56  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.359177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4291    81.48 
 
 
1275 bp  56  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0338    81.48 
 
 
2336 bp  56  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0339    81.48 
 
 
1262 bp  56  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3079    82.76 
 
 
1285 bp  54  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4821    82.76 
 
 
1282 bp  54  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.157057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2219    80.51 
 
 
1174 bp  52  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0168409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3286    80.33 
 
 
1269 bp  52  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2443  IS4 family transposase  83.56 
 
 
351 bp  50.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354426  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1833    82.02 
 
 
1227 bp  50.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4471    81.19 
 
 
743 bp  50.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0933718  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1832    82.02 
 
 
2608 bp  50.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2349    81.19 
 
 
1330 bp  50.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.609705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3095    80.56 
 
 
1286 bp  48.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.41964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0755    81.61 
 
 
1267 bp  46.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4776    81.61 
 
 
2583 bp  46.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.604839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4777    81.61 
 
 
1287 bp  46.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.371292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4986    81.61 
 
 
1841 bp  46.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4987    81.61 
 
 
1300 bp  46.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>