33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0571 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  53.41 
 
 
200 aa  181  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  52.3 
 
 
194 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  53.63 
 
 
198 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  48.57 
 
 
194 aa  167  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  52.54 
 
 
198 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  50.85 
 
 
272 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  48.28 
 
 
366 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  48.85 
 
 
299 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  45.61 
 
 
189 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  46.86 
 
 
194 aa  148  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  47.43 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  43.5 
 
 
183 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  42.94 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  42.94 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  41.58 
 
 
185 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  30.07 
 
 
286 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  29.19 
 
 
278 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  28.99 
 
 
311 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  27.54 
 
 
267 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  27.97 
 
 
287 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  28 
 
 
264 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  27.97 
 
 
304 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0491  hypothetical protein  27.84 
 
 
182 aa  51.2  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.754962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  27.08 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  23.53 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1090  hypothetical protein  31.58 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  25.35 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  24.7 
 
 
270 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  25.52 
 
 
263 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1056  hypothetical protein  26.71 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0117919 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  24.48 
 
 
209 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>