11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1056 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0117919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0491  hypothetical protein  52.78 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.754962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.17937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3621  hypothetical protein  38.71 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.776944  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0941  hypothetical protein  21.84 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  29.17 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0821  hypothetical protein  29.01 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0270056  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2542  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  26.71 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  27.82 
 
 		 272 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2796  hypothetical protein  24.82 
 
 		 191 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.988633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>