32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0837 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0837  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  208  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1063  hypothetical protein  59.18 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.513514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1295  hypothetical protein  64.77 
 
 
92 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920283  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00670  hypothetical protein  55.66 
 
 
122 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1598  hypothetical protein  62.5 
 
 
92 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4293  hypothetical protein  63.64 
 
 
95 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2289  hypothetical protein  60.92 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5768  hypothetical protein  59.77 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.959428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0793  hypothetical protein  55.1 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.321671  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4526  hypothetical protein  58.82 
 
 
123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.540117 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6781  hypothetical protein  59.77 
 
 
96 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406722  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6075  hypothetical protein  56.67 
 
 
124 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0756645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1344  hypothetical protein  56.67 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.431742  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1333  hypothetical protein  58.62 
 
 
293 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.784002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2985  hypothetical protein  58.62 
 
 
125 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3110  hypothetical protein  58.62 
 
 
125 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6485  hypothetical protein  56.67 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0097127  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5478  hypothetical protein  56.98 
 
 
118 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5608  hypothetical protein  53.41 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4511  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19335  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6338  hypothetical protein  53.41 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864224  normal  0.10452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3717  hypothetical protein  54.12 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2153  hypothetical protein  57.32 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2127  hypothetical protein  54.88 
 
 
94 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5906  hypothetical protein  57.32 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5447  hypothetical protein  51.72 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4312  hypothetical protein  53.57 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257675  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4202  hypothetical protein  53.57 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1866  hypothetical protein  63.64 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1159  hypothetical protein  50.57 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5292  hypothetical protein  48.84 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3634  hypothetical protein  67.92 
 
 
54 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00027053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>