32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5608 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5608  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6338  hypothetical protein  99.15 
 
 		 118 aa  236  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864224  normal  0.10452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6485  hypothetical protein  82.79 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0097127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1344  hypothetical protein  82.79 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.431742  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5478  hypothetical protein  81.97 
 
 		 118 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6075  hypothetical protein  86.36 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0756645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2985  hypothetical protein  68.75 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3110  hypothetical protein  68.75 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1333  hypothetical protein  68.75 
 
 		 293 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.784002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2289  hypothetical protein  79.31 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4511  hypothetical protein  76.47 
 
 		 109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5292  hypothetical protein  69.07 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5447  hypothetical protein  69.66 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1159  hypothetical protein  69.66 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4293  hypothetical protein  66.67 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3717  hypothetical protein  67.05 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0793  hypothetical protein  68.97 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.321671  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4202  hypothetical protein  68.97 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4312  hypothetical protein  68.97 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5768  hypothetical protein  58.1 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.959428 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6781  hypothetical protein  60 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1295  hypothetical protein  58.89 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4526  hypothetical protein  62.07 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.540117 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5906  hypothetical protein  60.71 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1063  hypothetical protein  58.33 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.513514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1598  hypothetical protein  52.87 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00670  hypothetical protein  59.09 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0837  hypothetical protein  53.41 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2153  hypothetical protein  54.88 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2127  hypothetical protein  52.44 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1866  hypothetical protein  63.24 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3634  hypothetical protein  57.69 
 
 		 54 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00027053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>