19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3077 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3077  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5564  hypothetical protein  78.35 
 
 
293 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8493  hypothetical protein  77.21 
 
 
331 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.419584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4058  hypothetical protein  61.32 
 
 
300 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2601  hypothetical protein  57.44 
 
 
294 aa  334  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2743  hypothetical protein  62.37 
 
 
312 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1366  putative aldolase  62.13 
 
 
316 aa  330  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3606  hypothetical protein  58.6 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4017  hypothetical protein  59.09 
 
 
294 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1802  hypothetical protein  61.51 
 
 
291 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.354933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4490  hypothetical protein  63.5 
 
 
407 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0938  hypothetical protein  56.99 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4541  hypothetical protein  61.25 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0661  hypothetical protein  62.45 
 
 
287 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5538  hypothetical protein  58.36 
 
 
289 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0726  hypothetical protein  51.58 
 
 
289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0821  hypothetical protein  54.2 
 
 
328 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5632  hypothetical protein  53.36 
 
 
304 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.45 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>