19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8493 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8493  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.419584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5564  hypothetical protein  84.88 
 
 		 293 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3077  hypothetical protein  77.16 
 
 		 295 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4058  hypothetical protein  62.21 
 
 		 300 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2743  hypothetical protein  65.38 
 
 		 312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2601  hypothetical protein  59.3 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3606  hypothetical protein  59.65 
 
 		 309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4017  hypothetical protein  61.4 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4541  hypothetical protein  63.67 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1366  putative aldolase  59.06 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1802  hypothetical protein  63.24 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.354933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4490  hypothetical protein  66.67 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0938  hypothetical protein  60.71 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0661  hypothetical protein  63.94 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5538  hypothetical protein  55.09 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0726  hypothetical protein  57.31 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0821  hypothetical protein  58.73 
 
 		 328 aa  268  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5632  hypothetical protein  54.75 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.73 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>