173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3239 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3239  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 318 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2281  putative glutathione S-transferase  56.63 
 
 		 330 aa  351  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.334105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0737  Glutathione transferase  53.11 
 
 		 331 aa  344  8.999999999999999e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2798  putative glutathione S-transferase protein  53.44 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830078  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3290  hypothetical protein  53.25 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3400  hypothetical protein  53.25 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0599  conserved hypothetical protein  52.94 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3259  hypothetical protein  52.94 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02971  predicted S-transferase  52.94 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02922  hypothetical protein  52.94 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0594  putative transferase  52.94 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3575  hypothetical protein  52.63 
 
 		 328 aa  341  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3062  Glutathione transferase  53.56 
 
 		 336 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.795635  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3424  hypothetical protein  53.25 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3556  putative glutathione S-transferase  53.42 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.997645  normal  0.49225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3494  glutathione S-transferase  52.94 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3528  glutathione S-transferase  52.94 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0794367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2220  putative glutathione S-transferase  54.46 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4417  hypothetical protein  52.63 
 
 		 328 aa  338  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0157  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.83 
 
 		 328 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3421  hypothetical protein  52.63 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0519  Glutathione transferase  51.84 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1579  IMP dehydrogenase/GMP reductase  52.32 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.39795  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5405  Glutathione transferase  54.28 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0652  glutathione S-transferase  54.43 
 
 		 333 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4332  hypothetical protein  54.43 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.164187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1761  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  52.92 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0457126  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2185  putative glutathione S-transferase  53.25 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.755538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1604  putative glutathione S-transferase  53.4 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0543  putative glutathione S-transferase  53.95 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1116  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.95 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.660957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3798  Glutathione transferase  51.38 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3749  putative glutathione S-transferase domain protein  51.69 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3520  Glutathione transferase  51.39 
 
 		 328 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0479  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.95 
 
 		 328 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.342726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0614  hypothetical protein  54.75 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1469  hypothetical protein  52.94 
 
 		 334 aa  329  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2008  glutathione S-transferase-like protein  52.85 
 
 		 319 aa  329  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02944  glutathione S-transferase  53.95 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2361  hypothetical protein  51.27 
 
 		 319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002964  predicted glutathione S-transferase  53.64 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3343  glutathione S-transferase domain protein  50.62 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1431  Glutathione S-transferase domain  53.56 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.858691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2137  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.46 
 
 		 339 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000359074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2507  hypothetical protein  50.96 
 
 		 319 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1060  glutathione S-transferase-like protein  54.37 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0432833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2451  glutathione S-transferase-like protein  53.25 
 
 		 328 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3241  hypothetical protein  52.56 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1170  Glutathione transferase  51.25 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.56227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2671  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.85 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0021828  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2004  putative glutathione S-transferase  51.59 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3010  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.07 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1561  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 		 327 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4602  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.58 
 
 		 328 aa  321  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2543  glutathione S-transferase  52.05 
 
 		 329 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4107  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.62 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1509  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2583  putative glutathione S-transferase  51.55 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378441  hitchhiker  0.0000439857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2598  hypothetical protein  53.92 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1201  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  51.95 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1656  glutathione S-transferase-like protein  51.23 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0858873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30350  hypothetical protein  53.61 
 
 		 324 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1276  glutathione S-transferase-like protein  51.91 
 
 		 321 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.248613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0270  glutathione S-transferase-like protein  53.77 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1455  glutathione S-transferase  50.31 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3394  Glutathione transferase  50.46 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0853  putative glutathione S-transferase  49.23 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01866  predicted glutathione S-transferase  47.62 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0169  putative glutathione S-transferase  50.62 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0368  putative glutathione S-transferase  50 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2382  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.72 
 
 		 332 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200845  hitchhiker  0.00582384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3998  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.79 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721034  hitchhiker  0.00627186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0702  putative glutathione S-transferase  48.62 
 
 		 327 aa  310  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1591  glutathione S-transferase  53.77 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0102059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2415  Glutathione transferase  46.96 
 
 		 377 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3580  fructose-bisphosphate aldolase  49.38 
 
 		 333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0374  hypothetical protein  51.59 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.520714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1835  glutathione S-transferase-like protein  50.79 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000726325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0242  glutathione S-transferase  53.44 
 
 		 333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0654  Glutathione S-transferase domain protein  49.04 
 
 		 312 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.969592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1137  glutathione S-transferase-like protein  50.62 
 
 		 333 aa  308  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.356258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3402  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 		 318 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.291765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1723  putative glutathione S-transferase  49.54 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.959435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3603  hypothetical protein  50.48 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3173  glutathione S-transferase  49.69 
 
 		 332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00834224  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2206  glutathione S-transferase domain  49.54 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2323  Glutathione transferase  48.48 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.131425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4679  glutathione S-transferase  50.62 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0018476  normal  0.811499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0421  Glutathione S-transferase domain protein  50.46 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0833  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.46 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2249  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.93 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.386562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3495  putative glutathione S-transferase  46.52 
 
 		 323 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0491711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0521  putative glutathione S-transferase  48.71 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2524  Glutathione S-transferase domain  48.93 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0524835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1686  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.05 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0800  glutathione S-transferase family protein  46.86 
 
 		 318 aa  291  8e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.170497  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1732  putative glutathione S-transferase  48.61 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1173  putative glutathione S-transferase  46.77 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1775  hypothetical protein  46.13 
 
 		 327 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4511  glutathione S-transferase-like  46.01 
 
 		 320 aa  288  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>