11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0217 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.961341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1985  hypothetical protein  40.31 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3871  hypothetical protein  41.4 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0949  hypothetical protein  39.8 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0453  hypothetical protein  40.31 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2106  hypothetical protein  40.31 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2374  hypothetical protein  39.29 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.379038  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1229  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3099  hypothetical protein  33.17 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0596  hypothetical protein  34.69 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2747  hypothetical protein  27.91 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>