11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2374 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.379038  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0453  hypothetical protein  77.55 
 
 		 196 aa  322  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2106  hypothetical protein  77.55 
 
 		 196 aa  322  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0596  hypothetical protein  53.85 
 
 		 194 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1985  hypothetical protein  44.39 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3871  hypothetical protein  43.88 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1229  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0217  hypothetical protein  39.29 
 
 		 238 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.961341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3099  hypothetical protein  39.36 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0949  hypothetical protein  38.64 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2747  hypothetical protein  35.88 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>