21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2364 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2364  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.14922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3099  hypothetical protein  39.56 
 
 
193 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0476915  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0777  hypothetical protein  36.46 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550599  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1002  hypothetical protein  37.77 
 
 
199 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.428939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5092  Protein of unknown function DUF1802  36.76 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2867  hypothetical protein  34.59 
 
 
199 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1855  Protein of unknown function DUF1802  31.16 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26264  predicted protein  32.21 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.901732  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12839  hypothetical protein  30.73 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625138  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4033  hypothetical protein  33.14 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12842  hypothetical protein  31.4 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000993835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2321  hypothetical protein  30.69 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0223039  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3247  hypothetical protein  30.95 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0626873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1250  hypothetical protein  28.87 
 
 
487 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2073  hypothetical protein  29.51 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0330237  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2090  hypothetical protein  29.51 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.542271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2136  hypothetical protein  29.51 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0133  hypothetical protein  22.78 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00159083  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2040  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1000  conserved hypothetical protein-like protein  28.65 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3068  Protein of unknown function DUF1802  26.54 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000880128  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>