20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1604 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1604  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  898    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4015  hypothetical protein  59.1 
 
 
454 aa  511  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0734  hypothetical protein  57.4 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  0.256321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2145  hypothetical protein  56.06 
 
 
452 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.657234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4321  hypothetical protein  55.76 
 
 
447 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127881  hitchhiker  0.00787899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4261  hypothetical protein  55.53 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2849  hypothetical protein  52.37 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1701  hypothetical protein  51.83 
 
 
473 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0255631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1188  hypothetical protein  50.21 
 
 
599 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1482  hypothetical protein  49.1 
 
 
521 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1112  hypothetical protein  48.24 
 
 
473 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3977  hypothetical protein  46.71 
 
 
465 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4019  hypothetical protein  46.71 
 
 
465 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0714  hypothetical protein  43.89 
 
 
461 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08961  hypothetical protein  41.28 
 
 
472 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1951  hypothetical protein  42.47 
 
 
450 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.816658  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2254  hypothetical protein  30.25 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.121888  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1345  hypothetical protein  29.16 
 
 
513 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1131  hypothetical protein  28.67 
 
 
530 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.208354  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14831  hypothetical protein  27.35 
 
 
575 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.266235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>