20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1951 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0714  hypothetical protein  72.63 
 
 
461 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1951  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  894    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.816658  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08961  hypothetical protein  60.09 
 
 
472 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1604  hypothetical protein  42.47 
 
 
450 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0734  hypothetical protein  38.86 
 
 
459 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  0.256321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1482  hypothetical protein  40.45 
 
 
521 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1701  hypothetical protein  40.13 
 
 
473 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0255631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4321  hypothetical protein  38.51 
 
 
447 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127881  hitchhiker  0.00787899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4261  hypothetical protein  38.29 
 
 
447 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4019  hypothetical protein  38.22 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2145  hypothetical protein  39.82 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.657234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3977  hypothetical protein  38 
 
 
465 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1112  hypothetical protein  36.4 
 
 
473 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1188  hypothetical protein  37.84 
 
 
599 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4015  hypothetical protein  37.45 
 
 
454 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2849  hypothetical protein  37.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1345  hypothetical protein  28.51 
 
 
513 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14831  hypothetical protein  26.07 
 
 
575 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1131  hypothetical protein  26.88 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.208354  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2254  hypothetical protein  26.35 
 
 
452 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.121888  normal  0.0494567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>