17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0410 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0410  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  189  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1926  hypothetical protein  60.67 
 
 
99 aa  116  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.388333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0945  hypothetical protein  58.62 
 
 
95 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2874  hypothetical protein  51.72 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000498688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0562  hypothetical protein  54.02 
 
 
96 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2676  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3294  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529107  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1262  hypothetical protein  44.94 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000603176 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0547  hypothetical protein  51.14 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0289  hypothetical protein  47.19 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0520  hypothetical protein  47.78 
 
 
102 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1788  hypothetical protein  47.62 
 
 
95 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1841  hypothetical protein  45.88 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1801  hypothetical protein  45.88 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2753  hypothetical protein  47.13 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2181  hypothetical protein  48.65 
 
 
39 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.109272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2200  hypothetical protein  48.65 
 
 
39 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>