17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0562 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0562  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2874  hypothetical protein  88.17 
 
 
94 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000498688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0945  hypothetical protein  75.79 
 
 
95 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3294  hypothetical protein  61.36 
 
 
91 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2676  hypothetical protein  61.36 
 
 
90 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0410  hypothetical protein  54.02 
 
 
90 aa  110  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0289  hypothetical protein  52.13 
 
 
94 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1926  hypothetical protein  52.17 
 
 
99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.388333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0520  hypothetical protein  56.82 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1788  hypothetical protein  53.57 
 
 
95 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1262  hypothetical protein  51.14 
 
 
92 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000603176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1801  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1841  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0547  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2753  hypothetical protein  46.24 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2200  hypothetical protein  55.26 
 
 
39 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2181  hypothetical protein  55.26 
 
 
39 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.109272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>