17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0341 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0341  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0130  hypothetical protein  31.88 
 
 
207 aa  94.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5271  hypothetical protein  30.12 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0885662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1481  hypothetical protein  34.71 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.141133  normal  0.453845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0559  hypothetical protein  31.61 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0576  hypothetical protein  31.61 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0443  hypothetical protein  30.99 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1018  hypothetical protein  31.14 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06261  hypothetical protein  31.74 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8654  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4948  hypothetical protein  26.92 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05201  hypothetical protein  30.46 
 
 
173 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5152  hypothetical protein  31.68 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49879  predicted protein  31.11 
 
 
253 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0475  uncharacterized membrane protein  27.88 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0634074  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11941  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.340527 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03731  hypothetical protein  24.38 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03721  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>