18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1635 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1635  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.113066  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0728  hypothetical protein  92.14 
 
 
239 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07791  hypothetical protein  72.2 
 
 
243 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.980398 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05351  hypothetical protein  71.9 
 
 
242 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05581  hypothetical protein  68.05 
 
 
251 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.744316  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05881  hypothetical protein  72.73 
 
 
251 aa  342  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.146518  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0532  hypothetical protein  67.22 
 
 
251 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05961  hypothetical protein  69.09 
 
 
243 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05881  hypothetical protein  66.52 
 
 
241 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.329508  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1863  hypothetical protein  66.07 
 
 
241 aa  320  8e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.275235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0468  hypothetical protein  66.51 
 
 
231 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136655  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0455  hypothetical protein  66.51 
 
 
231 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2533  hypothetical protein  65.14 
 
 
231 aa  298  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1593  hypothetical protein  65.3 
 
 
231 aa  296  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.286358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3371  hypothetical protein  64.38 
 
 
232 aa  295  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0839772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2280  hypothetical protein  59.92 
 
 
251 aa  295  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.869055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0398  hypothetical protein  57.98 
 
 
231 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0341668  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2986  hypothetical protein  50.46 
 
 
233 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280564  normal  0.827828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>