17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1144 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1144  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.607759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1330  hypothetical protein  70.64 
 
 
223 aa  321  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14701  beta-propeller domain-containing protein  50.45 
 
 
227 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0336822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0806  hypothetical protein  34.62 
 
 
245 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4385  protein of unknown function DUF477  33.04 
 
 
237 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3192  hypothetical protein  30.18 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.298274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3379  protein of unknown function DUF477  31.1 
 
 
240 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1329  hypothetical protein  35.48 
 
 
208 aa  101  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0033  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3599  protein of unknown function DUF477  31.52 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2515  protein of unknown function DUF477  31.52 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.25616  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17635  predicted protein  26.7 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.265392 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09451  fusion glycoprotein F0  34.52 
 
 
103 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0937  fusion glycoprotein F0-like  37.88 
 
 
103 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.193778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09961  fusion glycoprotein F0  40.91 
 
 
103 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09981  fusion glycoprotein F0  36.36 
 
 
103 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.398133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  41.6  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>