18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0924 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0924  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  290  7e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1023  hypothetical protein  72.41 
 
 
145 aa  219  9e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18421  hypothetical protein  55.86 
 
 
159 aa  166  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10631  hypothetical protein  50.68 
 
 
173 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0024  hypothetical protein  51.35 
 
 
179 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.715255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06441  hypothetical protein  51.35 
 
 
179 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126924  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0588  hypothetical protein  37.76 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0538718  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06431  hypothetical protein  37.76 
 
 
147 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06531  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1786  hypothetical protein  38.19 
 
 
175 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0540666  normal  0.173958 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06141  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1320  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0014  hypothetical protein  38.16 
 
 
173 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.933141  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4474  hypothetical protein  38.06 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3998  hypothetical protein  33.56 
 
 
176 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3355  hypothetical protein  34.27 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.932275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2654  hypothetical protein  33.8 
 
 
177 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3450  hypothetical protein  33.8 
 
 
177 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>