15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2608 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2608  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  176  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143386  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2245  hypothetical protein  73.13 
 
 
89 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0841  hypothetical protein  44.62 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19271  hypothetical protein  43.84 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1056  hypothetical protein  43.84 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.850366  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08981  hypothetical protein  43.08 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09001  hypothetical protein  41.54 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06781  hypothetical protein  35.38 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.875942  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1414  hypothetical protein  37.5 
 
 
83 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1193  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2833  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0944667  normal  0.216335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2793  hypothetical protein  36 
 
 
144 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0891  hypothetical protein  29.73 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173413  decreased coverage  0.0000877955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4455  hypothetical protein  35.09 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2066  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>