16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1193 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1193  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  244  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1259  hypothetical protein  46.91 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2793  hypothetical protein  48.15 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2066  hypothetical protein  43.21 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4455  hypothetical protein  46.25 
 
 
163 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2090  hypothetical protein  43.21 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0833  hypothetical protein  45.68 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.208747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0672  hypothetical protein  40.74 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2962  hypothetical protein  41.98 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2833  hypothetical protein  43.59 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0944667  normal  0.216335 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0891  hypothetical protein  39.24 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173413  decreased coverage  0.0000877955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1911  hypothetical protein  38.75 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4568  hypothetical protein  39.44 
 
 
84 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506895  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1414  hypothetical protein  41.67 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2608  hypothetical protein  36.21 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143386  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2245  hypothetical protein  37.04 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>