13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1752 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1752  pectate lyase  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0886563  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26421  Pectate lyase  71.37 
 
 		 331 aa  332  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.625545 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2373  pectate lyase  40.48 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1132  hypothetical protein  33.62 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3505  hypothetical protein  28.38 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0319  hypothetical protein  29.73 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.871629  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28211  hypothetical protein  29.53 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0509227 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14231  hypothetical protein  32.73 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0113009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3359  hypothetical protein  42 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3441  hypothetical protein  36.36 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1756  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.286218  normal  0.186217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1502  hypothetical protein  32.1 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0657  hypothetical protein  27.21 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>