17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0629 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0629  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  278  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.253238  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1733  hypothetical protein  82.41 
 
 
119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1795  hypothetical protein  54.64 
 
 
120 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05181  hypothetical protein  55.43 
 
 
120 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.530336 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05271  hypothetical protein  41.35 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.909098  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05191  hypothetical protein  42.59 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04881  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0463  hypothetical protein  40.74 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1077  hypothetical protein  45.65 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.351072  hitchhiker  0.000889304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1769  hypothetical protein  39.13 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0386  hypothetical protein  38.24 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1957  hypothetical protein  38.95 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1800  hypothetical protein  38.2 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34298  normal  0.166358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4291  hypothetical protein  37 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4351  hypothetical protein  37 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1420  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00907666  normal  0.176068 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42548  predicted protein  28 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>