31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4814 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  100 
 
 		 65 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  92.19 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  76.92 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  73.85 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  73.85 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  73.85 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  72.31 
 
 		 65 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  66.15 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  66.15 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  79.69 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  64.62 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  64.62 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  75 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  55.38 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  46.88 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  50.77 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  50.77 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  50.77 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  50.77 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  68.18 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  46.15 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  46.15 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  45.31 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  50.77 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  49.23 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3614  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>