31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0058 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 66 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  81.82 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  79.69 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  77.78 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  77.78 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  77.78 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  76.19 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  73.85 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  69.84 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  69.84 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  69.84 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  69.84 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  71.21 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  50.77 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  53.03 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  51.52 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  51.52 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  51.52 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  45.31 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  68.25 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  43.75 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  51.52 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  46.15 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3614  hypothetical protein  47.69 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>