31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39700  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7089  hypothetical protein  70.1 
 
 
210 aa  288  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.670641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4582  hypothetical protein  62.44 
 
 
218 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466428  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5100  hypothetical protein  60.91 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.333  hitchhiker  0.000000366045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7331  hypothetical protein  57.44 
 
 
212 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9378  hypothetical protein  60 
 
 
206 aa  237  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.744975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4974  hypothetical protein  61.22 
 
 
205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3580  hypothetical protein  58.16 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4539  hypothetical protein  55.38 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  58.67 
 
 
230 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4505  hypothetical protein  53.4 
 
 
244 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4689  GCN5-related N-acetyltransferase  51.04 
 
 
224 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.969792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5404  hypothetical protein  46.26 
 
 
269 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6428  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
204 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6070  hypothetical protein  45.91 
 
 
246 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  0.16061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0836  hypothetical protein  45.74 
 
 
249 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.485389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13951  hypothetical protein  44.55 
 
 
244 aa  168  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5781  hypothetical protein  44.2 
 
 
249 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5494  hypothetical protein  44.2 
 
 
249 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5405  hypothetical protein  44.2 
 
 
249 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4235  hypothetical protein  45.09 
 
 
239 aa  167  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4856  hypothetical protein  38.74 
 
 
261 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2684  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2479  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2383  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2893  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1378  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.321123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1286  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.081046  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0827  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
185 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0482934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0374  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
155 aa  41.6  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.918937  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  38.46 
 
 
172 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>