26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4505 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4505  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4582  hypothetical protein  60.75 
 
 
218 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466428  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4974  hypothetical protein  60.45 
 
 
205 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5100  hypothetical protein  60.28 
 
 
221 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.333  hitchhiker  0.000000366045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3580  hypothetical protein  61.24 
 
 
205 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9378  hypothetical protein  61.72 
 
 
206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.744975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7331  hypothetical protein  55.91 
 
 
212 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4539  hypothetical protein  57.89 
 
 
212 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  54.5 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7089  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.670641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39700  acetyltransferase (GNAT) family protein  53.4 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5404  hypothetical protein  48.88 
 
 
269 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4689  GCN5-related N-acetyltransferase  48.31 
 
 
224 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.969792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5494  hypothetical protein  43.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5781  hypothetical protein  43.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5405  hypothetical protein  43.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0836  hypothetical protein  42.98 
 
 
249 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.485389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6428  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
204 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13951  hypothetical protein  44.16 
 
 
244 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6070  hypothetical protein  43.93 
 
 
246 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  0.16061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4235  hypothetical protein  44.6 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4856  hypothetical protein  40.57 
 
 
261 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.815619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
188 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0251687  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1567  GCN5-related protein N-acetyltransferase  38.27 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0779  hypothetical protein  31.43 
 
 
203 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>