40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34610  Nodulation protein A (NodA)  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4025  acyltransferase NodA  32.32 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7717  acyltransferase NodA  31.5 
 
 
196 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096789  normal  0.952102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3832  acyltransferase NodA  33.5 
 
 
214 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6184  acyltransferase NodA  30.1 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2281  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4916  acyltransferase NodA  30.26 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5036  acyltransferase NodA  29.74 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01220  acetyltransferase (GNAT) family protein  38.6 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  29.37 
 
 
286 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  28.67 
 
 
286 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7732  acetyltransferase  35.8 
 
 
193 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  29.37 
 
 
286 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  29.63 
 
 
286 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  27.97 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  27.78 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  27.78 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  24.69 
 
 
286 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03220  hypothetical protein  27.35 
 
 
165 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.554181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2407  hypothetical protein  36.08 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.565519  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1069  acetyltransferase  34.02 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4467  acetyltransferase, GNAT family  32.2 
 
 
277 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0564586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0770  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
277 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000560272  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  35.38 
 
 
149 aa  44.7  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4550  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  35.09 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  35.09 
 
 
277 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  30.3 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  34 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4094  acetyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2674  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08251  putative acetyltransferase  39.34 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4429  acetyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1614  acetyltransferase  35.42 
 
 
167 aa  41.2  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>