12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31780  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.928007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4141  hypothetical protein  52.46 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4216  hypothetical protein  52.46 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4372  hypothetical protein  52.46 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4666  hypothetical protein  44 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0710  hypothetical protein  67.27 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0942  hypothetical protein  57.5 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3144  hypothetical protein  40.28 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4416  hypothetical protein  50.88 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1640  hypothetical protein  37.86 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11101  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.08678e-19  normal  0.0977065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.698805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>