12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0710 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0710  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  229  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4141  hypothetical protein  53.45 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4216  hypothetical protein  53.45 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4372  hypothetical protein  53.45 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3144  hypothetical protein  44.16 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4666  hypothetical protein  47.5 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0942  hypothetical protein  34.83 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31780  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.928007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4416  hypothetical protein  46.77 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11101  hypothetical protein  62.22 
 
 		 88 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.08678e-19  normal  0.0977065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0926  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295436  normal  0.309602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0729  hypothetical protein  47.22 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>