13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25910  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5518  hypothetical protein  60.36 
 
 		 181 aa  197  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11648  hypothetical protein  57.34 
 
 		 147 aa  158  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3351  hypothetical protein  60.87 
 
 		 150 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3017  hypothetical protein  56.64 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3557  hypothetical protein  62.02 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3002  hypothetical protein  55.88 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3048  hypothetical protein  55.88 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2429  protein of unknown function DUF402  50.3 
 
 		 269 aa  137  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2866  hypothetical protein  44.31 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1277  hypothetical protein  32.52 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5519  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0817  protein of unknown function DUF402  31.25 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>