20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24960  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5773  hypothetical protein  50.94 
 
 		 253 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2653  FHA domain-containing protein  39.29 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3024  hypothetical protein  41.07 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0506215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3932  hypothetical protein  42.71 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00962883  normal  0.143235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12194  proline rich membrane protein  40 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000001803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3263  FHA domain-containing protein  41.41 
 
 		 370 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3274  FHA domain-containing protein  41.41 
 
 		 337 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3325  FHA domain-containing protein  41.41 
 
 		 370 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.101615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3530  FHA domain-containing protein  40.62 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2981  hypothetical protein  39.39 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3269  hypothetical protein  37 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00361684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10740  hypothetical protein  28.19 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0131667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1563  hypothetical protein  29.31 
 
 		 220 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.940639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2664  hypothetical protein  31.08 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2933  hypothetical protein  30.56 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0889  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1186  septum formation initiator  39.18 
 
 		 98 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5105  hypothetical protein  38.27 
 
 		 431 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.276858  normal  0.0604071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0836  cell division protein FtsL  34.62 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.528872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>